以施用有機肥料為主的基肥，最宜秋施。秋施基肥的時間，以中熟品種采收后、晚熟品種采收前為最佳，一般為9月下旬至10月上旬。秋施基肥，具有以下好處：
      第一，蘋果主要根系分布層的土壤溫度比較適宜，根系生長量大，吸收機能也比較活躍，施肥后有利于根系吸收。第二，施肥后有利于提高葉片的光合效率，增加碳水化合物的積累。第三，秋季施用有機肥料，有較充分的時間供根系吸收、運轉，并在樹體內貯藏起來。長期的施肥試驗證明，秋季施肥(特別是氮肥)，至次年春季芽萌動前，蘋果新梢內的淀粉含量、氮素含量，以及嫩芽內的過氧化氫酶活性均有顯著提高。干周增長量大，花芽質量好，生殖器官發育完善，坐果增多，果實產量和品質都有顯著提高。因此，秋季施用基肥，是蘋果園施肥制度中的重要環節，也是全年施肥的基礎。
      基肥要把有機肥料和速效肥料結合施用。有機肥料宜以遲效性和半遲效性肥料為主，如豬圈糞、牛馬糞和人糞尿等，根據結果量一次施足。速效性肥料，主要是氮素化肥和過磷酸鈣。為了充分發揮肥效，可先將幾種肥料一起堆腐，然后拌勻施用�；�肥的施用量，按有效成分計算，宜占全年總施肥量的70%左右，其中化肥的量應占全年的2/5。